在生活中，越來越多地方需要用到協議書，協議書協調著人與人，人與事之間的關系。想必許多人都在為如何寫好協議書而煩惱吧，以下是小編收集整理的保稅區報關、運輸合作協議書，僅供參考，大家一起來看看吧。
甲方：
乙方：
甲、乙雙方經友好協商，就甲方指定gep（上海）貨物委托乙方代理收貨進保稅區及港口代辦轉運等一系列報關、報檢、運輸、代運分撥等業務達成如下協議：
一、甲方職責
1、甲方在每批貨物到港前一天向乙方提供已由收貨人簽章好的正確、完整的船運單證（即b/l海運提單及報關單證），雙方確定專人交接并紀錄時間。
2、甲方委托乙方清關，應提供正確、完整的報關單據，內容包括與船運單證相符的貨物中文品名、稅則號碼、數量、金額、重量等。如有問題乙方應及時通知甲方立即解決。
3、甲方應協助乙方及時解決換取港區提單過程中所有發生的問題。
4、甲方委托乙方代辦商檢，應提供正確的外商投資財產價值鑒定申請單及上海市外商投資企業進口物資審批表等文件，以利于乙方及時辦理商檢并進行報關。
5、甲方所委托的貨物應以出口標準妥善包裝，應適應長途海運和內陸運輸，任何由于甲方包裝不善而造成的損失由甲方負責；任何由于乙方操作不當而造成的.損失由乙方負責。
6、原則上，甲方對每批貨物的操作要求中，運輸計劃需在作業前一天12小時前，收發貨指令至少在作業前2個小時以書面傳真形式通知乙方落實，特殊情況下，乙方應盡力配合處理。
二、乙方職責
1、乙方在接到甲方提供的正本海運提單后到船公司（或代理）調換港區提貨單，如遇到問題及時與甲方取得聯系并解決。
2、 遇到貨物必須商檢時，乙方在接到甲方合格的申報單等單證后代理甲方申報商檢。
3、乙方在接到甲方齊全的報關材料后繕制報關單并負責報關，如遇到倉單錯誤并負責解決。
4、 對于甲方委托的保稅區海關報關業務，乙方在正常情況下非法檢貨物在船到后四天內予以完成清關、送貨等服務，對法檢進口設備在船到后五天內予以完成清關、送貨等服務，如有特殊情況發生，甲乙雙方應積極協調及時解決。
5、乙方負責報關后辦理有關港區提貨手續，同時安排集卡到港區提箱至甲方指定地點。
6、乙方負責對海關事物提供必要的詳盡咨詢服務。
7、乙方原則上不負責墊付操作過程中所產生的費用，由甲方墊付fob條款海運費。
8、若貨物至乙方倉庫后應通知甲方派人到現場驗收并拆箱入庫（貨物的外包裝、件數等以上海外輪代理理貨公司出具的證明為準）。
9、貨物經甲方驗收入庫后應有乙方負責妥善保管，不得損壞、使用，未經甲方同意，不得私自開包或開箱，在保管期內，如果……
三、作業確認規定
1、書面確認是雙方公司具體操作人員所具有的權利，也是應盡的義務，無論哪一方提出對某項操作要求書面確認時，另一方都必須相應，否則提出方有權停止相關操作進程，直到獲得書面確認。
2、新發展物流公司客戶服務部在每月____號、____號（逢雙休日或節假日往后順延）開兩次賬單到crc shipping部門。crc相關部門在十天內核對完賬單后，每月月底書面通知新發展物流公司開發票，在核對過程中，crc相關部門有權對賬單中的任何一個費用項目提出查詢，新發展物流公司必須無條件配合，如新發展物流公司無充分證據證明任何一個費用項目的正確性，crc有權對此項目拒付，但不影響其他費用的正常確認。費用賬單一經crc確認，新發展物流公司將不再承擔查詢賬單及其相關單據的義務。
3、對于超期費的事宜，新發展物流公司必須先行向crc進行書面確認，否則crc有權拒付。crc在收到新發展物流公司確認單____個工作日內必須給于明確的答復，否則新發展物流公司視為crc自動確認。至于目前還存在一些超期費用的問題，只要是非我方原因造成的超期，客觀事實清楚的，crc必須全部確認。
4、為了在今后核對帳單中提高效率，以及單證的準確性，經征詢新發展物流公司財務部以及新發展物流公司供應商意見和可操作性，決定代收代付的費用今后一律開“新發展物流代ge”或“新發展物流代crc”，新發展物流公司憑復印件向crc報銷。
5、關于費用超期問題，只要在整票業務操作完畢后（尤指pc粉落箱）____個月內結算，都應是合理正常。但如有意外情況逾期，則需雙方書面確認為準，憑確認單結算。
6、在今后具體操作過程中，凡是合同中沒有列明的費用項目，當以雙方經辦人員書面確認為準，憑確認單結算。
四、費用結算程序
1、乙方負責每周對已完成作業的項目按提單號開具發票，并分別列明海運進、出口或空運進、出口發票清單每周五交于甲方專人核對，每月____日前將前一月操作費用清單交甲方，額外費用（指超期費，修箱費等）另計，甲方核對后乙方開具發票。甲方保證在接到乙方發票的一個月內付清發票所列款項，付款時應傳真乙方付款憑證。
2、對乙方開具操作費用如由實報實銷部分需附有關發票并注明費用標準。甲方審核時如有異議，應及時與乙方專人聯系解決，如乙方發票開具錯誤，應由乙方立即到甲方領取該發票并保證在第二天將正確發票送至甲方專人。
3、對乙方應甲方要求支付的費用則按第二條的七款執行。
4、由于甲、乙雙方的一方未能執行以上費用結算規定，責任方按發生額每月度以____%向另一方支付違約金或滯納金以示公允。
五、本協議未盡事項由甲、乙雙方協商解決，如政策因素發生費用變化，雙方本著友好協作精神妥善處理。
六、本協議的任何修正須經雙方書面以備忘錄形式同意方為有效，修正部分作為本協議的補充。
七、附件一、二為本協議不可分割的部分。
八、本協議未盡事宜，雙方友好協商解決。
九、本協議自____年___月___日起生效，一式兩份，效力相同，甲乙雙方各執一份。本協議有效期一年，到期后甲乙雙方若無異議則本協議自動延期一年。
甲方： 乙方：
代表： 代表：
日期： 日期：
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