由于學術論文所涉及的學科和性質不同，研究領域、對象和方法不同，論文的表現手法、使用范圍也不盡相同，因此，學術論文就有不同的分類方法。
1、按研究領域和對象，可分為人文社科類論文、自然工程類論文與醫學科學類論文。
人文社科類論文是以人文、社會現象為研究對象的學術論文，其任務是研究并闡述各種人文社會現象及其發展規律，研究領域涉及的范圍廣，類型復雜交錯。根據學科內容的不同，人文社科類論文可細分為哲學學科論文、語言文學學科論文、歷史學科論文、藝術體育學科論文、經濟學科論文、政治學科論文、法學學科論文、管理學科論文、教育學科論文等。人文社科類論文就研究方法與行文角度而言，可以將其分為論述型、評價型、考證型、證明型、介紹型、詮釋型、調查報告等論文類型。
自然工程類論文，也稱為理工科類論文，其研究目的是發現自然現象背后的規律，并運用這些規律為人類社會發展做出貢獻。其中，自然科學論文側重于對自然本體進行研究和描述，揭示自然界發生的客觀現象以及自然現象背后的規律，具有客觀性強、計量細、實驗數據多等特點。工程科學論文側重于運用科學和技術原理來解決人類社會發展進步中存在的問題。自然工程論文按照功能和屬性，還可以將其分為實驗型、理論型、綜述型論文與科學調查（考察）報告等。
醫學科學類論文，也稱醫科類論文。醫科是對有關醫療、藥物、公共衛生等研究領域的學科統稱，醫學科學類論文就是以人類自身身體及其所患疾病、所受損傷等為研究對象，以診斷治療預防生理疾病和提高人體機體健康為目的。
2、按研究內容和方法，可分為理論型、實驗型、描述型、設計型學術論文。
理論型學術論文的研究對象是比較廣泛的自然現象和社會現象，以及這些現象之間的關系，即抽象的理論問題。其基本研究方法主要是理論證明、數學推導和綜合考察等。
實驗型學術論文是以實驗本身作為研究對象，或者以實驗作為主要手段得出研究成果后撰寫的學術論文。它的核心內容是設計實驗，進行實驗研究，對實驗結果的觀察和分析，探討客觀事物和現象發生的原因和規律，形成結論或提出作者的見解。
描述型學術論文是以自然和社會存在的.客觀事物和現象為研究對象，其研究方法是考察、觀測和分析，其主要表達方式是描述、說明和比較，目的在于向讀者介紹新發現的具有科學價值的客觀事物和現象。因此，它的重點在于說明事物和現象是什么，并確認其種屬、學科等，和類似事物或現象有何不同，而沒有復雜的理論推導、邏輯分析。
設計型學術論文的研究對象是新工程、新產品的設計，主要研究方法是對新的設計方案或實物進行全面論證，從而得出某種結論或引出某些規律
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