當前我國的住房公積金存在如下的管理和監督體制問題：公積金的管理中心應為一個獨立的不以盈利為目的的事業單位，但有些地區的住房公積金管理中心卻靠掛在其他單位；住房公積金實行屬地管理體制，這造成管理不統一，各地的政策不同、收費不同、手續繁簡也不同；目前我國住房公積金管理委員會的委員均為兼職，缺乏專業的住房公積金業務知識，不能正確的進行決策和監督，決策權流于形式；大部分的住房公積金管理部門尚未建立內部審計制度，缺乏內部控制，管理混亂增加了公積金的風險；尚未建立高素質的監管隊伍和監管體系，監管體系薄弱。
可以采取下面的措施來加強新形勢下的住房公積金風險管理與控制：
（一）擴大住房公積金的覆蓋力度和保障范圍
住房公積金的繳存范圍尚未完全允許城鎮個體工商戶、自由職業人員繳存住房公積金，享受權益。此外，還有大量的企業沒有為特殊工作者繳納住房公積金，例如進城務工的農民工。我們必須以法律強制實施，加大執行力度，加強對這部分特殊工作者的保障力度。
（二）加大沉積住房公積金利用，提高住房公積金利用率
住房公積金利用范圍有限，利用率不高，為了促進住房公積金的運用，我們可以采取如下策略：1、提高住房公積金貸款額度，降低住房公積金的貸款利率。公積金貸款在我國屬于政策性貸款，當前我國房價已經超出了很多人的承受范圍，各級地方政府應當根據實際情況調節貸款額度，盡量拉大與商業貸款利率的差距，滿足廣大職工多樣化的住房貸款需求，切實起到政策性住房金融的作用。2、住房公積金制度要發揮住房保障作用，應盡量使公積金留在住房領域內發揮效用。將盈余的住房公積金投入保障性住房建設項目，可以為政府提供更多的資金和房源，有助于解決保障性住房建設資金缺口，幫助更多的低收入家庭解決住房困難，同時又可以提高住房公積金使用效率，達到“雙贏”的效果。3、用住房公積金余額投資。中國證監會主席郭樹清在2011年12月說，住房公積金需要考慮開設投資途徑。住房公積金余額是一筆巨大的資金，如果預算節約下來的錢可以積累進入一個特殊的投資基金，對國家、對市場、對每一個公民都是有好處的。
（三）完善住房公積金管理制度，充分發揮住房公積金監督系統的監督作用
任何形式的管理都需要完善的管理制度來約束管理行為，住房公積金監督系統應該充分發揮其監督作用，以降低住房公積金的管理風險，保證住房公積金運營的安全。1、加強專業的住房公積金管理隊伍的建設。安全管理住房公積金，需要一批高素質的專業人才，他們將專業地分析住房公積金風險問題，進而研究出防范與解決風險的對策；提高住房公積金管理委員會委員的'專業性能，從而能夠正確有效的進行決策，提高住房公積金的運營效率。2、建立健全的內部控制制度。要高度重視住房公積金的內部控制工作，加強內部控制制度的組織機構建設，加強內部控制制度的法制建設，合理設置內部控制體系的崗位，建設綜合的住房公積金管理信息系統，建立雙重風險防范機制，為住房公積金管理中心創造一個良好的資金運營環境，保證住房公積金的安全和保值增值，提高管理的效益。
在當今社會住房問題的嚴峻形勢下，我們必須要做好住房公積金的風險管理工作。在現有的住房公積金管理制度下，相關工作人員要加強對住房公積金風險的分析，完善住房公積金管理制度，切實控制好風險，提高住房公積金的利用效率，為更多的普通職工解決住房問題，進而促進我國房地產市場的發展和我國經濟的發展。
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