良好的教學秩序需要教師的用心經營。就目前科學課的課堂教學現實而言，教師要堅持“學生是科學學習的主體”和“探究是科學學習的主要方式”這兩條教學基本原則，在具體的教學細節上加強對學生常規學習行為習慣和科學學習方式的指導，努力做到讓學生“活”而不“亂”，讓課堂“動”而不“鬧”。
一、有人考察過國外的小學科學教學，他們發現兒童上科學課時總是很安靜，說話聲很小，這既是個人素養的良好表現，也反映了教學狀態之有序。難道我們的兒童天生是個吵鬧者？其實不然，他們小時候也會一個人安安靜靜地擺弄玩具，也會用半天時間癡迷地看小螞蟻爬動……浸泡在科學的世界中樂此不彼。回歸安靜，表面上看只是強調了教學秩序在“聲音”這一維度上的表現，有的人甚至會批評安靜的課堂背后隱喻著“思維的停滯和情感的冷漠”，但我們同樣難以想象，在高分貝的環境中學生保持思維的連貫性和情感意志的理性。心理學研究成果表明：安靜沉穩的心態有利于孩子提升思維的廣闊性和深刻性。他們天生是個探究者，是個傾聽者。說得嚴重些，正是我們的教學把他們變成了一個個會吵會鬧的.無蠻嬰孩。值得注意的是，回歸安靜的課堂與重返死氣沉沉的課堂是完全是兩回事。
二、“有序”與“和諧”無疑是相近的兩個詞。課堂做到了和諧自然也就有序，之所以無序，正是因為課堂中出現了許多不和諧的音符。不懂謙讓，不肯傾聽，不愿順從……，這些現象多了，教學秩序便無法保證，更別談教學的靈動性和流暢性了。孩子的個性的確需要尊重，只是不要讓它演變成培植自我主義的溫床。學生的自我中心傾向如果不能夠得到有效地約束，合作、溝通、交流、評價都陷于形式，甚至連形式也很難堪實現。表現欲強固然是小學生的心理特征，但如果不加以調訓則更不利于他們日后的學習和心理成長。“調則和諧，放則滋生”，教學中合理的感化和引導是教學中必不可少的，其長遠價值不言而喻。
三、有思維的課堂總是讓人感覺上去很有品質和力量。相反，缺少了思維彌漫的課堂，不管教學設計有多么精巧，感覺上去總覺得缺少了一股“精氣神”。當學生忙于思維的時候，還有誰會去擔心教學秩序的問題呢？特級教師與普通教師所執教的科學課，其最大的特質就在于能夠牢牢地抓住學生的心靈，不斷地推動他們去思考和聯想。也許他們的教學手段是如此的傳統無奇，又或許他們為學生準備的器材很平常，但他們卻總能在教學的不經意間暗置玄機，在一波又一波地探究與設問中把學生引向最終的目的地。有一點是應當明確的：科學課上的探究活動并不是越多越好，也并不是越熱鬧越好，在活動中最好能有思維上的訓練參插其中，這樣的科學課才顯得有份量。
四、不管是以前的自然課，還是現在的科學課，只要教師說一聲開始實驗，用不了一秒種，我們的學生便會一站而起，簇擁一團，這似乎成了這門學科無法擺脫的鮮明印記。很多教師對于出現這種情形都無計可施，自然也只能由學生去“自主探究”了。甚至有人說：“只要學生有興趣，上桌子也不要緊。”此話過矣！現在的問題不是扶植學生的興趣，而恰恰是如何更好地利用學生對探究活動的高度熱情。勿須諱言，學生過度強烈的參與意識所帶來的已不再是探究價值的提升，相反已經拖滯了科學學習的效率。蒙臺梭利曾說：“孩子的自由，就其限度而言，應在維護集體利益范圍之內；就其行為方式而言，應具有我們一般所認為的良好教養。因此，只要孩子冒犯或干擾他人，有不禮貌或粗野行為，就應加以制止。”
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